我国《“十五”计划纲要》要求“形成一批拥有著名品牌和自主知识产权、主业突出、核心能力强的大公司和企业集团”。自“企业集团”这一概念提出以来，企业集团这一与市场化取向改革相适应的新型产业组织形态得到迅速发展。企业集团作为一种新型产业组织形态给现行所得税政策带来了许多新问题，诸如纳税人如何确定、区域税收管辖权如何协调、相关税务检查如何实施等。同时，现行所得税政策中也存在一些不利于企业集团发展壮大的因素。为适应新形势的需要，有必要在所得税税制及税收管理方面加以改进。

　　一、企业集团所得税税收管理上的难点问题

　　（一）纳税人及纳税申报的确定

　　我国现行的企业所得税政策中对企业集团征税问题没有明确统一的规定，现在一般有3种征税方法：（1）由集团下属企业分别作为独立纳税人缴税；（2）由企业集团作为独立纳税人统一缴税；（3）由集团下属企业先缴税，然后由税务机关与集团再进行结算。由于企业集团纳税人的确定及纳税方式的多样性，究竟应把集团还是其下属各个企业作为独立纳税人，规定不够明确。《中华人民共和国企业所得税暂行条例》（以下简称《企业所得税暂行条例》）规定，对大型企业集团分别以核心企业、实行独立核算的其他企业为纳税人，在企业所在地申报纳税。事实上对企业集团纳税形成两种情况：如果由独立核算的其他企业作为纳税人缴税，这同一般企业无任何区别；但如果以核心企业作为纳税人缴税，也就意味着集团的非核心企业所得应汇总至集团核心企业统一缴税。由集团核心企业统一缴税，将进一步涉及到是由集团成员先就地预缴再由核心企业汇总清算，还是由核心企业统一缴税的问题。如果由核心企业统一缴税，那么就存在是对成员企业所得按各自适用税率征税，还是按核心企业适用税率统一缴税，以及税收如何在地区之间划分等问题。

　　（二）计算方法问题

　　内资企业对外（指到国内的其他地区）投资，从国内的联营、合资企业取得利润，由联营或合资企业向其所在地税务机关纳税，对于投资者从联营、合资企业分回的利润一般不再征税。但如果地区间所得税适用税率存在差异的，分回的利润应按投资方税率计算缴纳所得税，但从联营、合资企业分回利润已经缴纳的所得税允许扣除。内资企业分回利润补缴所得税主要存在以下问题：（1）内资企业和外商投资企业在分回利润纳税处理上不一致，即外商投资企业对分回利润采用免税法，而内资企业采用抵免法。（2）当联营合资企业享受减免税优惠时，从联营、合资企业分回利润在计算补税时减免税应视同纳税抵扣，但在计算从联营、合资企业分回利润还原成税前所得时是按法定税率还是按实际税率计算纳税，税法上没有明确规定。（3）投资方如果有亏损，从联营、合资企业分回利润应先弥补亏损，弥补亏损后余下利润部分再予以补税。如果投资方从联营、合资企业分回的利润有需要补税的利润和不需要补税的利润，应先用需要补税的利润来补亏，不足部分再用不需要补税的利润补亏。但如果先用不需要补税的利润补亏，对企业而言实际上是亏损弥补优惠的取消。

　　（三）区域税收管辖权的协调问题

　　近年来，随着企业集团的迅速发展，大多数企业集团将其总公司设在经济较发达的地区，以便利用其市场信息、交通、通讯、人才技术和政策优势，而为了开拓市场，往往在不发达或欠发达地区设立分公司或子公司，企业集团可充分使用其定价权，使分公司或子公司的货物销售行为一般都平进平出，没有增值，这样增值额、总收益实际归集在总公司所在地，发达地区地方政府分配的财政收入相对较多，因而这些地区可以从地方财政收入中拿出一部分资金用于支持该企业集团的发展。这种做法加剧了地区间经济发展的不平衡，使资源的有效配置发生扭曲，不利于缩小东西部地区的差距，也不利于国家宏观调控政策的实现。尤其值得注意的是，有些大型企业集团不但运用合法定价权将税收集中缴纳到所在地主管税务机关，甚至对销售其货物的非分公司或子公司，也运用非法手段如提高批发价格而同时向销售商支付销售费用等来达到同样的目的。这种局面下，不但分公司、子公司销售大量货物无增值税可缴，且由于销售收益集中于总公司，导致分公司、子公司也无所得税可缴，对于此类现象，分公司、子公司所在地的地方政府和主管税务机关反应强烈。有些地方的主管税务机关对这类销售行为采取核定销售额进行征收的办法，实际上是把税收征收管理权扩大为税收管辖权。这种核定征收的办法理所当然地引起企业的强烈反对。同时，由于影响到相当规模税收收入的归属，影响到不同地方政府之间财政收入的分配，也引起了企业集团所在地主管税务机关和分公司、子公司所在地主管税务机关的争议。

　　（四）应纳税的时间性差异

　　根据《企业所得税暂行条例》的规定，如果投资方企业所得税税率高于联营企业，投资方企业分回利润应按规定补缴所得税。由于现行税法对经济特区、经济技术开发区、民族地区等实行税收优惠政策，企业纷纷增加向这些地区的投资，这就存在着企业所得税补缴的问题。按照会计准则规定，投资企业应在期末以权责发生制为基础按被投资企业的净利润或净损失及投资比例确认投资收益和损失；但按税法规定，投资收益以收付实现制为基础，需待投资企业实际分得利润或被投资企业宣告分派利润时，才计入应税所得，从而产生应纳税额的时间差异。

　　（五）税务检查的实施

　　我国企业集团所得税税务检查的难点，主要集中于对企业集团内部关联交易的检查，尤其是对于一些上市公司而言。首先是对企业集团内部关联交易的认定，虽然通过企业纳税资料的分析，可以判断出有些公司属于一个企业集团的组成部分，但从这些资料中却很难得到有关关联人员及其关联交易的信息；其次是间接关联关系的存在，间接关联关系如由上市公司控制的子公司之间，上市公司与同一母公司的并列公司之间，上市公司股东及其附属公司对上市公司有重大影响的等。这种关系往往极其隐蔽，给税务检查带来不便；再次是对关联交易价格的确认，价格是关联交易的核心问题，会计准则虽要求企业披露定价策略，却没有规定定价方法。

　　二、现行企业所得税制与支持企业集团发展的矛盾

　　（一）现行企业所得税制本身的弊端

　　1.差别比例税率不利于企业集团的形成。我国现行的企业所得税实行差别比例税率，即按企业应纳税所得额的大小分别适用33%、27%和18%的比例税率。一些原本适用18%或27%比例税率的小企业，被购并后，要按照并入的大企业所适用的税率即33%统一纳税，这相对增加了被购并企业的税收负担，致使其对购并产生抵制情绪；由于购并企业并未因此得到税收方面的好处，就可能削弱其对扩大规模、组建企业集团的积极性。另外，这种差别税率使得一些小企业为了享受较低的税率而不愿走规模经济的道路；而一些大企业为了少纳所得税，也化整为零组建若干个规模较小的企业，这必然造成资源的极大浪费，也不利于我国大企业集团战略的施行。

　　2.重复征税。目前，我国企业所得税实行的是独立公司所得税制，即企业所得税与个人所得税独立课征。对企业取得的所得，在企业层次上征收企业所得税，对分配给股东的股息在个人层次上征收个人所得税。这有利于组织财政收入，却存在重复征税的问题，不利于企业集团的发展。（1）抑制了股东投资的积极性，企业难以较好地筹集资金，不利于企业扩大生产规模。（2）不利于企业更多地选择股份制方式筹资，抑制了企业规模和股权的合理变动，不利于企业并购重组。另外，企业集团的核心企业和成员企业都保持着独立的法人地位，按现行税法规定，核心企业对紧密层企业资产控股比例为100%的，由控股成员选择核心企业统一合并纳税。对不是统一合并纳税的企业如参股企业，则存在着同一所得重复征税的问题。这不利于企业集团的形成和发展。

　　3.税收流失。一方面，一些地方、部门往往以促进企业改制为由要求对企业给予税收优惠，企业所得税成为被要求开减免税口子的主要目标。另一方面，由于对企业的破产、合并、兼并、分立和股权转让中所发生的亏损处理、资产损失、债权和债务的承继、欠缴税款的追缴、如何享受税收优惠等问题，税法上缺乏明确的规定，有的企业为享受新办企业的税收优惠而改组，有的企业为逃避欠税而脱壳分离，这些情况都造成了所得税的征管困难和所得税收入的流失。