2.4 建设性原则
在经济效益审计中贯彻建议性原则时必须注意以下问题：一是遵循谨慎性原则；二是审计建议应建立在事实清楚、分析透彻的基础上；三是审计建议要建立在客观事实的基础上，具有政策上的可操作性，并且符合国家法律和国家的产业政策。
3 不断总结经验，加强对经济效益审计的理论研究
经济效益审计的理论研究在我国仍然很欠缺，这已成为制约经济效益审计实践的一个突出问题。为了更好地开展经济效益审计，加强对经济效益审计的理论研究已刻不容缓。这就要求必须狠下工夫，从历史的、现实的角度对经济效益审计的理论进行立体的研究。在当前经济效益审计研究领域下，下列几个问题与我国经济效益审计发展紧密相关，必须重点研究并加以解决。
3.1 尽快构建经济效益审计的理论框架
到目前为止，审计理论界尚未构建出一套经济效益审计自身的所独有的完整的理论框架和逻辑体系。我国经济效益审计的理论框架中除基础理论和应用理论之外，还应该包括经济效益审计的发展理论。经济效益审计基础理论是研究经济效益审计规律性的理论，这种理论的客观性最强，一般不受时间限制或限制很少，研究结果表现为一套概念、目标、原则、惯例与方法等，对经济效益审计实践不具有人为的强制性；经济效益审计应用理论是研究经济效益审计实践中一些具体性问题的理论，这种理论的客观性比较强，受时间的限制大，研究结果往往表现为具体的措施、政策或建议，对经济效益审计实践以及时的规范；经济效益审计发展理论是研究经济效益审计的全局性、方针性和方向性问题的理论，这种理论的主观性比较强，时间跨度比较大，它是综合基础理论的研究成果并结合应用理论，对未来提出比较明确的构想，研究成果表现为长期的重大行动方案。
3.2 明确经济效益审计的学科地位
要讨论经济效益审计的学科地位，首先应讨论该学科的研究对象是否具有独立性。之所以有人对经济效益审计的学科地位产生怀疑，就是对这门学科的研究对象不能明确把握，只是在管理或审计的概念下理解经济效益审计的研究对象，而没有把对学科技术尤其是信息技术进步的认识上升到对审计创新的高度，并在这个高度上去开发和建立经济效益审计的研究对象。相反的是，在此同时，甚至有人有意避开对研究对象的讨论，而只把经济效益审计当作一门技术课和方法课来讨论，或者盲目追随其他领域的理论，试图用其他领域的理论成果来提高经济效益审计的学科地位，显然不利于经济效益审计的建设和发展。因此，从经济效益审计的研究内容来看，它完全冲破了传统审计条条框框的束缚，广泛吸收了现代行为学科、管理学科、数学和系统理论等理论的基础理论，并将人类科学所有的先进成果都创造性地在审计工作中使用，形成一门新兴的多学科的交叉学科。该学科与其他学科存在着许多密切的必然联系，但这并不影响经济效益审计学科的独立性，它本身自己独特的理论和方法，只是有待进一步完善。
3.3 重视经济效益审计的研究方法
经济效益审计的研究方法是我们把握经济效益审计的途径、手段、工具和方式的总和，它所要解决的问题是“怎样才能正确的认识经济效益审计”。经济效益审计的研究方法有丰富的内涵和外延，而思维方法是经济效益审计研究方法的核心。经济效益审计研究的思维方法包括三个层次：第一层次是方法论；第二层次是基本方法；第三层次是具体方法。
3.4 强化经济效益审计的应用研究
经济效益审计的应用研究既是经济效益审计理论研究的需要，也是经济效益审计实践发展和教学改革的需要。经济效益审计的应用研究具有极广大的空间和深度，是财务审计所难以比拟的。关注经济效益审计实践，根据其研究对象的具体性和特殊性，研究任务和目标的针对性等特点来界定经济效益审计应用研究的内容，运用实验研究、创造性的实务研究及案例研究相结合的方法，分析经济效益审计的实践对经济效益审计改革的启示，将有助于我们更好地认识、注解和运用经济效益审计理论，更好地为经济建设服务。在经济效益审计中，尽管我们已经引入了很多诸如网络技术、财务分析等经济效益审计工具，但由于缺乏对这些工具差异与互补关系的理论认识，致使实践中在具体运用这些工具时缺乏系统性，从而不利于经济效益审计功能的发挥。这就要求必须整合经济效益审计的应用体系，以期发挥经济审计的作用。
