5）有利于加强主管部门对机构的财务监管。
通过对科研机构的财务分析，可及时、客观地向主管部门的决策提供充分有效的财务信息，使决策者及时了解和掌握各个科研机构的经济运行秩序、单位的财务管理情况，从而可及时、真实地考核科研机构科技经费的使用效益。
3．构建科研机构财务分析体系的基本原则
1） 区分不同的财务分析主体及其分析目的。
财务分析的基本目的是对科研机构一定期间的运营、财务效益、持续从事公益事业的能力等方面，进行定量和定性对比分析，以查明其真实情况和存在的问题。财务分析主体是指对经济组织进行财务分析的个人、组织等。不同的主体在同一经济组织中有不同的利益要求，因而进行财务分析的目的也不同，如投资者关注投入资源的使用，经济组织的可持续发展能力，债权人关注还本付息能力等。进行财务分析的目的取决于自身的利益需求。不同的分析目的需要不同的信息，不同的信息需要不同的分析方法体系和指标体系。
对于科研机构而言，财务分析的主体可分为主管部门、科研机构管理者和社会相关利益者。主管部门进行财务分析的主要目的是进行财务监管，关注投入资源的使用，经济组织的可持续发展能力等，管理者进行财务分析的主要目的在于提高单位的财务管理水平，社会相关利益者主要关注的是单位的运行是否符合其宗旨。因此，在建立财务分析体系时，应妥善解决这些问题。
2）科学设置财务分析指标。
财务分析指标体系应按照“内容全面、重点突出、操作简便、信息客观”的原则制定，依据科研机构的业务性质，合理确定核心指标及各影响因素指标，根据不同分析目的，设置多层次指标体系，依据综合全面分析的要求，同时设置财务指标和非财务指标，核心指标和辅助指标，定量指标和定性指标。
2） 合理选择分析方法。
财务分析的方法体系包括定性分析法和定量分析法。定量分析法主要包括比较分析法、比率分析法、综合分析法等。不同类型的方法所用的耗费不同，所获得的财务指标评价也不同，为此，应以成本效益原则和指标重要性为依据，合理选择适用的财务方法，例如，对于单位整体业绩的评价，宜选用综合评价方法，对于单位某一方面的分析，宜选择比较分析法成比率分析法等。
4．构建科研机构财务分析体系的基本设想
经过改革，科研机构的性质发生了很大变化，形成了企业性科研机构，非营利性机构和公立事业单位并存的格局，在公立事业单位中，既有准政府部门（执行部门政府职能），又有以从事商务活动并获取收入为营利组织，也有半企业性质的单位。更为重要的是，科研机构自身业务活动以科研为主，科研活动具有长期性、不确定性和非直接营利性的特点，因此，财务分析体系的设计必须考虑这些特点。综上所述，构建科研机构财务分析体系的设想如下：
1）确立合理的财务分析程序和分析步骤。
财务分析的一般程序和步骤在理论上尚
有争议，但通常认为，财务分析的一般程序应包括准备、实施、评价和报告四个阶段，每个阶段均匀有相应的步骤。科研机构的财务分析程序和步骤包括确定分析对象、财务分析准备，实施财务分析、财务评价和财务分析报告等。
2）建立科学的财务分析框架。
财务分析框架的基本构成包括财务分析主体及分析目的、财务指标体系、财务指标标准值、分析依据、财务分析方法等。财务分析目标应依据科研机构的总目标和财务管理目标确定。财务分析指标则依据财务分析的目标确定。组织性质不同，其核心指标不同，营利组织侧重利润等经济效益，非营利组织侧重组织宗旨的实现程度等。
3）选择科学的财务指标。
建立科研机构财务分析指标体系所选择的各项财务指标，应便于理解、易于操作，便于及时收集真实数据和计算，能全面、科学地反映单位的财务资源状况、绩效、管理水平等。不但要重视经济指标，还应重视社会责任、单位职能方面的指标。
